Package: exonerate (2.4.0-5 and others) [debports]
Links for exonerate
Debian Resources:
Download Source Package :
Not foundMaintainers:
External Resources:
- Homepage [www.ebi.ac.uk]
Similar packages:
strumento generico per il confronto di sequenze di coppie
Exonerate permette l'allineamento di sequenze tramite molti modelli di allineamento, usando una programmazione dinamica esaustiva o una varietà di euristiche. Molte delle funzionalità della suite di programmazione dinamica Wise sono state reimplementate in C per una migliore efficienza. Exonerate è un componente intrinseco della struttura dei database genomici Ensembl, che fornisce punteggi di somiglianza tra sequenze di RNA e di DNA e così determinando varianti di splicing e sequenze di codifica generali.
Un sistema di simulazione per esperimenti PCR In-silico (vedere la pagina man di ipcress) è fornito con exonerate.
Questo pacchetto contiene una selezione di utilità per effettuare velocemente semplici manipolazioni su file fasta oltre i 2 Gb.
Other Packages Related to exonerate
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)
- libreria GLib di routine in C
-
- sug: wise
- confronto tra biopolimeri, come DNA e sequenze proteiche
-
- enh: bioperl-run
- wrapper BioPerl: script
Download exonerate
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
hppa (unofficial port) | 2.4.0-5+b1 | 2,026.8 kB | 9,361.0 kB | [list of files] |