Package: boxshade (3.3.1-14) [debports]

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belle stampe di allineamenti multisequenza

Boxshade è un programma per creare stampe di bell'aspetto a partire da sequenze proteiche o di DNA multi-allineate. Il programma non fa il reale allineamento e necessita di un file input creato da un programma per allineamenti multipli o creato a mano con strumenti adatti.

Boxshade legge sequenze multiallineate da file PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data e ESEE-save, (limitatamente ad un massimo di 150 sequenze con fino a 10.000 elementi ciascuna). Vari tipi di ombreggiatura possono essere applicati a residui identici/simili. L'output è scritto a schermo o in un file nei seguenti formati: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML.

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc6 (>= 2.11)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• sug: kalign

  allineamenti multipli di sequenza globali e progressivi

  or clustalw

  allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi

  or mafft

  programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche

  or hmmer

  profilamento di modelli di Markov nascosti per analisi di sequenze proteiche

• sug: seaview

  interfaccia multipiattaforma per l'allineamento di sequenze e filogenia

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

• sug: xfig

  strumento per generazione interattiva di figure in X11

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
hppa (unofficial port)	52.0 kB	157.0 kB	[list of files]