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Package: gwama (2.2.2+dfsg-6 and others)

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meta-analisi di associazioni a livello di intero genoma

Il software GWAMA (Genome-Wide Association Meta Analysis) esegue meta-analisi dei risultati di studi GWA su fenotipi binari o quantitativi. Meta-analisi di effetti fissi e casuali sono effettuate per SNP, sia genotipizzati direttamente sia imputati, usando stime della probabilità allelica e un intervallo di confidenza del 95% per tratti binari, e stime della dimensione dell'effetto allelico ed errore standard per fenotipi quantitativi. GWAMA può essere usato per analizzare i risultati di tutti i differenti modelli genetici (moltiplicativo, additivo, dominante, recessivo). Il software incorpora funzionalità di intercettazione degli errori per identificare errori di allineamento dei filamenti e flipping degli alleli ed esegue test di eterogeneità degli effetti tra gli studi.

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