Package: python3-cobra (0.29.1-1)

[ Source: python-cobra  ]

modellazione di reti biologiche basata su vincoli con Python 3

I metodi COBRA (COnstraint-Based Reconstruction and Analysis) sono ampiamente usati per la modellazione a livello di intero genoma di reti metaboliche sia nei procarioti che negli eucarioti. COBRApy è un pacchetto di modellazione basata su vincoli che è progettato per essere adatto alle complessità biologiche della prossima generazione di modelli COBRA e fornisce accesso ai metodi COBRA usati comunemente, come analisi del bilancio di flusso, analisi di variabilità di flusso e analisi di delezione di geni.

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• dep: python3-httpx

  next generation HTTP client

• dep: python3-importlib-resources

  Read resources from Python packages

• dep: python3-numpy

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• dep: python3-pandas

  strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"

• dep: python3-platformdirs

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• dep: python3-pydantic

  Data validation and settings management using Python type hinting

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  libreria System Biology Markup Language - collegamenti Python 3

• dep: python3-swiglpk (>= 5.0.8-1~)

  semplici collegamenti Python per GNU Linear Programming Kit (Python 3)

• dep: python3-tabulate

  stampa abbellita di dati tabellari in Python 3

• sug: python3-matplotlib

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