Package: nanook (1.33+dfsg-5)

[ Source: nanook  ]

analisi pre- e post-allineamento di dati di sequenziamento Nanopore

NanoOK è un software flessibile, multi-riferimento per analisi pre- e post-allineamento di dati di sequenziamento Nanopore, profili di errore e qualità.

NanoOK (pronunciato ne-nuc) è uno strumento per estrazione, allineamento e analisi di letture Nanopore. NanoOK estrae letture come file FASTA o FASTQ, le allinea (con una scelta di strumenti di allineamento), poi genera un esaustivo rapporto multipagina in PDF contenente analisi di resa, accuratezza e qualità. Durante il processo genera file in testo semplice che possono essere utilizzati per ulteriori analisi, oltre a grafi utilizzabili per l'inclusione in presentazioni ed articoli.

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