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assemblatore di letture lunghe del genoma basato su hinging

HINGE è un assemblatore di genoma che cerca di ottenere una risoluzione ottimale delle ripetizioni distinguendo le ripetizioni che possono essere risolte sulla base dei dati, da quelle che non possono esserlo. Ciò è ottenuto aggiungendo "cerniere" alle letture per costruire un grafo di sovrapposizioni nel quale solo le ripetizioni irrisolvibili sono fuse. Come risultato, HINGE combina la resilienza agli errori degli assemblatori basati sulle sovrapposizioni con le capacità di risoluzione delle ripetizioni degli assemblatori di grafi de Bruijn.

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