Package: covtobed-examples (1.3.5+dfsg-2)

[ Source: covtobed  ]

dati di esempio e script per mindthegap

Legge uno o più file di allineamento (BAM ordinati) e stampa un BED con la copertura. Unirà basi consecutive con la stessa copertura e può essere usato per stampare un file BED solamente con le regioni che hanno uno specifico intervallo di copertura.

Questo pacchetto è pensato per accompagnare covtobed.

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  converte la traccia di copertura da un file BAM in un file BED

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