Package: apbs (3.4.1-6)
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- Homepage [www.poissonboltzmann.org]
Similar packages:
risolutore adattivo di Poisson-Boltzmann
APBS è un pacchetto software per la risoluzione numerica delle equazioni di Poisson-Boltzmann (PBE), uno dei modelli continui più popolari per descrivere le interazioni elettrostatiche di soluti molecolari in soluzioni acquose salate. L'elettrostatica del continuo gioca un ruolo importante in molte aree di simulazione biomolecolare, incluse:
* simulazione di processi di diffusione per determinare la cinetica del legame ligando-proteina o proteina-proteina; * dinamica molecolare del solvente implicito di biomolecole; * calcolo della solvatazione e dell'energia di legame per determinare le costanti di equilibrio del legame ligando-proteina e proteina-proteina e per facilitare la progettazione razionale di farmaci; * studi di titolazione biomolecolare.
APBS è stato progettato per valutare in modo efficiente le proprietà elettrostatiche in tali simulazioni per un'ampia gamma di larghezze di scala per permettere lo studio di molecole con decine e fino a milioni di atomi.
Questo pacchetto contiene il programma apbs e le utilità.
Other Packages Related to apbs
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- dep: apbs-data (= 3.4.1-6)
- file di dati per APBS (Adaptive Poisson Boltzmann Solver)
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- dep: libamd3 (>= 1:7.0.1)
- libreria di ordinamento al minimo grado approssimato per matrici sparse
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- dep: libapbs3t64 (= 3.4.1-6)
- risolutore adattivo di Poisson-Boltzmann
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- dep: libarpack2t64 (>= 2.1)
- sottoroutine Fortran77 per risolvere problemi agli autovalori in larga scala
-
- dep: libblas3
- implementazione di riferimento dell'algebra lineare di base, libreria condivisa
- or libblas.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libcamd3 (>= 1:7.0.1)
- libreria di ordinamento al minimo grado approssimato simmetrico per matrici sparse
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- dep: libccolamd3 (>= 1:7.0.1)
- libreria di ordinamento approssimato per colonne con vincoli per matrici sparse
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- dep: libcholmod5 (>= 1:7.3.1)
- libreria di fattorizzazione sparsa di Cholesky per matrici sparse
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- dep: libcolamd3 (>= 1:7.0.1)
- libreria di ordinamento COLAMD per matrici sparse
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- dep: libfetk1.9t64 (>= 3.4.1)
- FETK libraries for APBS (shared libraries)
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- dep: libgomp1 (>= 4.2.1)
- libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
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- dep: libjs-mathjax
- motore di visualizzazione JavaScript per LaTeX e MathML
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- dep: libmaloc1 (>= 0.2-1)
- Object-oriented Abstraction Layer for C
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- dep: libmpich12
- Shared libraries for MPICH
-
- dep: libspqr4 (>= 1:7.8.3+dfsg)
- libreria di fattorizzazione QR sparsa
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- dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
-
- dep: libsuitesparseconfig7 (>= 1:7.0.1)
- routine di configurazione per tutti i moduli di SuiteSparse
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- dep: libsuperlu7 (>= 7.0.0+dfsg1)
- Direct solution of large, sparse systems of linear equations
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- dep: libumfpack6 (>= 1:7.0.1)
- libreria di fattorizzazione LU sparsa
Download apbs
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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armel | 75.8 kB | 314.0 kB | [list of files] |