Package: libedlib1 (1.2.7-6 and others)

[ Source: libedlib  ]

libreria per allineamento di sequenze usando la distanza di modifica

Libreria C/C++ leggera e super-veloce per l'allineamento di sequenze usando la distanza di modifica.

Il calcolo della distanza di modifica di due stringhe è semplice come:

 edlibAlign("ciao", 4, "world!", 6,
            edlibDefaultAlignConfig()).editDistance;

Funzionalità:

 * Calcolo della distanza di modifica (distanza di Levehnstein).
 * Può trovare il percorso ottimale di allineamento (istruzioni su come
   trasformare la prima sequenza nella seconda sequenza).
 * Può trovare solo le posizioni iniziali o quelle finali, o entrambe, di
   un percorso di allineamento (può essere utile quando la velocità è più
   importante che avere un percorso di allineamento esatto).
 * Gestisce più metodi di allineamento: globale(NW), prefisso(SHW) e
   infisso(HW), ciascuno utile per differenti scenari.
 * Si può estendere la definizione dell'uguaglianza dei caratteri,
   abilitando ad esempio i metacaratteri, per ottenere un allineamento
   indifferente a maiuscole e minuscole o per lavorare con nucleotidi
   degenerati.
 * Può gestire sequenze piccole o molto grandi, anche per la ricerca del
   percorso di allineamento, consumando pochissima memoria.
 * Super-veloce grazie all'algoritmo di Myers per vettori di bit.

Questo pacchetto contiene la libreria condivisa.

Tags: Role: Shared Library

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