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Package: shovill (1.1.0-2) [debports]

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assemblaggio di genomi di isolati batterici da letture Illumina a terminali accoppiati

Shovill è una pipeline che usa SPAdes come suo nucleo centrale, ma modifica i passaggi prima e dopo il passo di assemblaggio primario, per ottenere risultati simili in un tempo minore. Shovill gestisce anche altri strumenti per assemblaggio, come SKESA, Velvet e Megahit, perciò si può sfruttare la pre- e post-elaborazione fornita da Shovill anche con essi.

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