Package: r-bioc-genomicalignments (1.40.0-1) [debports]
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rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor
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- dep: libc6.1 (>= 2.4)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
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- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.19
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)
- funzioni generiche per Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)
- funzionalità BioConductor per valutazione parallela
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)
- oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)
- utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi
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- dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)
- allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)
- implementazione di vettori e liste per BioConductor S4
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- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)
- BioConductor assay container
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- sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.72.0)
- infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings
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- sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.44.0)
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- sug: r-bioc-edger (>= 4.2.0)
- analisi empiriche per dati digitali di espressione genica in R
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- sug: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)
- strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle
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- sug: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0)
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- sug: r-bioc-shortread (>= 1.62.0)
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- sug: r-cran-knitr
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- sug: r-cran-runit
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Download r-bioc-genomicalignments
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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alpha (unofficial port) | 2,109.1 kB | 3,447.0 kB | [list of files] |