Package: python3-vcf (0.6.8+git20170215.476169c-10 and others) [debports]

[ Source:  ]

analizzatore di Variant Call Format (VCF) per Python 3

Variant Call Format (VCF) specifica il formato di un file di testo usato in bioinformatica per memorizzare variazioni di sequenze di geni. Il formato è stato sviluppato con l'avvento di progetti di sequenziamento di DNA e di genotipizzazione su larga scala, come il 1000 Genomes Project.

L'intento di questo modulo è di imitare il modulo "csv" nella stdlib di Python, in contrasto con formati più flessibili di serializzazione come JSON o YAML. "vcf" tenterà di analizzare il contenuto di ogni record sulla base dei tipi di dato specificati nelle righe di meta-informazioni, e precisamente le righe ##INFO e ##FORMAT. Se tali righe sono mancanti o incomplete, controllerà i tipi riservati menzionati nelle specifiche. In mancanza di ciò, restituirà semplicemente delle stringhe.

Questo pacchetto fornisce i moduli per Python 3.

Other Packages Related to python3-vcf

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-pkg-resources

  rilevazione di pacchetti e accesso a risorse usando pkg_resources

• dep: python3-pysam

  interfaccia al formato SAM/BAM per allineamento e mappatura di sequenze (Python 3)

Download python3-vcf

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.6.8+git20170215.476169c-10+b1	48.5 kB	230.0 kB	[list of files]