allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti
DIALIGN-TX è uno strumento a riga di comando per fare allineamenti multipli
di sequenze proteiche o di DNA. È una completa reimplementazione
dell'approccio basato su segmenti che include diverse nuove migliorie e
modelli euristici che migliorano significativamente la qualità degli
allineamenti in output rispetto a DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Per
l'allineamento di coppie, DIALIGN-TX usa un algoritmo di concatenazione
dei frammenti che favorisce catene di allineamenti locali a basso
punteggio rispetto a frammenti isolati ad alto punteggio. Per gli
allineamenti multipli, DIALIGN-TX usa una procedura migliorata che è
meno sensibile a somiglianze spurie tra sequenze locali.
