Package: r-bioc-pwalign (1.2.0-1) [debports]

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Experimental package

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effettua allineamenti di sequenze a coppie

Le due funzioni principali nel pacchetto sono pairwiseAlignment() e stringDist(). La prima risolve problemi di allineamento globale (Needleman- Wunsch), allineamento locale (Smith-Waterman) e allineamento di sovrapposizione (terminali liberi). La seconda calcola la distanza di edit di Levenshtein o la matrice del punteggio di allineamento a coppie per un insieme di stringhe.

Other Packages Related to r-bioc-pwalign

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  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

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• dep: r-bioc-biocgenerics

  funzioni generiche per Bioconductor

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  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

• dep: r-bioc-iranges

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors

  implementazione di vettori e liste per BioConductor S4

• dep: r-bioc-xvector

  rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ppc64 (unofficial port)	739.1 kB	1,209.0 kB	[list of files]