Package: r-bioc-rsamtools (2.22.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-rsamtools  ]

Experimental package

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allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

Questo pacchetto fornisce un'interfaccia alle utilità "samtools", "bcftools" e "tabix" per la manipolazione di SAM (Sequence Alignment / Map), BCF (binary variant call) e file delimitati da tab indicizzati e compressi (tabix).

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  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

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  Package not available

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• dep: r-cran-bitops

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• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-genomicalignments

  rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)

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• sug: r-cran-knitr

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• sug: r-cran-runit

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	3,469.2 kB	5,831.0 kB	[list of files]