Package: r-bioc-rtracklayer (1.66.0-1)

[ Source: r-bioc-rtracklayer  ]

Experimental package

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interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

Infrastruttura estensibile per interagire con più navigatori di genomi (attualmente incorporato UCSC) e manipolare tracce di annotazioni in vari formati (attualmente incorporati GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig e 2bit). L'utente può esportare e importare tracce verso e dai navigatori gestiti, così come interrogare e modificare lo stato del navigatore, come l'attuale porzione visualizzata.

Other Packages Related to r-bioc-rtracklayer

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2)

  libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione OpenSSL)

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  toolkit Secure Sockets Layer - librerie condivise

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.35.3)

  funzioni generiche per Bioconductor

• dep: r-bioc-biocio

  standard input and output for Bioconductor packages

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6)

  rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.37.2)

  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.13)

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18)

  implementazione di vettori e liste per BioConductor S4

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

  rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-curl

  client web moderno e flessibile per GNU R

• dep: r-cran-httr

  strumenti GNU R per lavorare con URL e HTTP

• dep: r-cran-restfulr (>= 0.0.13)

  interfaccia GNU R a servizi web RESTful

• dep: r-cran-xml (>= 1.98-0)

  pacchetto GNU R per l'analisi e la generazione di XML

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

• sug: r-bioc-genefilter

  metodi per filtrare geni da esperimenti con microarray

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-limma

  modelli lineari per dati di microarray

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

  annotazioni a livello di tutto genoma per l'Uomo

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
arm64	5,078.8 kB	6,702.0 kB	[list of files]