Package: qcumber (1.0.14+dfsg-1)

[ Source: qcumber  ]

controllo di qualità di sequenze genomiche

QCPipeline è uno strumento per controllo di qualità. Il flusso di lavoro è il seguente:

 1. controllo di qualità con FastQC
 2. taglio delle letture con Trimmomatic
 3. controllo di qualità delle letture tagliate con FastQC
 4. mappatura delle letture sui riferimenti usando bowtie2
 5. classificazione delle letture con Kraken

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