Package: pbhoney (15.8.24+dfsg-3)

[ Source: pbsuite  ]

genomic structural variation discovery

PBHoney is an implementation of two variant-identification approaches designed to exploit the high mappability of long reads (i.e., greater than 10,000 bp). PBHoney considers both intra-read discordance and soft-clipped tails of long reads to identify structural variants.

PBHoney is part of the PBSuite.

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  mappatura di letture di sequenziamento di singole molecole

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  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)

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  interfaccia Python di uso generico per hdf5 (Python 2)

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• dep: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

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