Package: r-bioc-phyloseq (1.26.1+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-phyloseq  ]

gestione ed analisi per GNU R di dati di censimenti di microbiomi ad alte prestazioni

Il modulo Bioconductor phyloseq fornisce un insieme di classi e strumenti per facilitare l'importazione, l'archiviazione, l'analisi e la visualizzazione grafica di dati di censimenti di microbioma.

Other Packages Related to r-bioc-phyloseq

• dep: r-api-3.5

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.8

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.36.2)

  funzioni base per Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.22.0)

  funzioni generiche per Bioconductor

• dep: r-bioc-biomformat (>= 1.0.0)

  pacchetto di interfaccia per GNU R per il formato di file BIOM

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.40.0)

  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

• dep: r-bioc-multtest (>= 2.28.0)

  Bioconductor resampling-based multiple hypothesis testing

• dep: r-cran-ade4 (>= 1.7-4)

  analisi GNU R di dati ecologici

• dep: r-cran-ape (>= 5.0)

  pacchetto GNU R per analisi su filogenesi ed evoluzione

• dep: r-cran-cluster (>= 2.0.4)

  pacchetto GNU R per analisi di cluster di Rousseeuw et al.

• dep: r-cran-data.table (>= 1.10.4)

  estensione GNU R di data.frame

• dep: r-cran-foreach (>= 1.4.3)

  gestione di cicli foreach in GNU R

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 2.1.0)

  implementazione di Grammar of Graphics

• dep: r-cran-igraph (>= 1.0.1)

  analisi e visualizzazione di reti per GNU R

• dep: r-cran-plyr (>= 1.8.3)

  strumenti per dividere, applicare e combinare dati

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.4.1)

  riorganizza in modo flessibile i dati: nuova reimplementazione del pacchetto reshape

• dep: r-cran-scales (>= 0.4.0)

  funzioni di scalatura per la visualizzazione

• dep: r-cran-vegan (>= 2.5)

  pacchetto per ecologia delle comunità per R

• rec: r-cran-testthat (>= 1.0.2)

  suite di test di GNU R

• sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.16.1)

  pacchetto R per analisi RNA-Seq di espressione differenziale

• sug: r-bioc-genefilter (>= 1.58)

  metodi per filtrare geni da esperimenti con microarray

• sug: r-bioc-metagenomeseq (>= 1.14)

  analisi statistiche per GNU R per sequenziamento sparso ad alte prestazioni

• sug: r-cran-knitr (>= 1.16)

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown (>= 1.6)

  convert R markdown documents into a variety of formats

Download r-bioc-phyloseq

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	2,040.3 kB	2,966.0 kB	[list of files]