Package: openms-common (2.4.0-real-1)

[ Source: openms  ]

pacchetto per gestione ed analisi di dati LC/MS - dati condivisi

OpenMS è un pacchetto per gestione ed analisi di dati LC/MS. OpenMS offre un'infrastruttura per lo sviluppo di software relativo alla spettrometria di massa e potenti soluzioni per la visualizzazione 2D e 3D.

OpenMS offre analisi per vari protocolli di quantificazione, inclusa quantificazione label-free, SILAC, iTRAQ, SRM, SWATH…

Fornisce algoritmi incorporati per identificazione de-novo e ricerche in database, così come adattatori per altri strumenti all'avanguardia come X!Tandem, Mascot, OMSSA…

OpenMS gestisce i formati PSI (Proteomics Standard Initiative) per i dati MS e permette una facile integrazione degli strumenti nei motori per flussi di lavoro come Knime, Galaxy, WS-Pgrade e TOPPAS attraverso il concetto TOPPtools e una gestione unificata dei parametri.

Questo pacchetto contiene i dati condivisi dai diversi binari del pacchetto software OpenMS (librerie libOpenMS e libOpenMS_GUI e gli strumenti binari della pipeline per proteomica di OpenMS).

Other Packages Related to openms-common

• sug: libopenms2.4.0 (= 2.4.0-real-1)

  libreria per gestione ed analisi di dati LC/MS - runtime

• sug: topp (= 2.4.0-real-1)

  insieme di programmi che implementano TOPP (The OpenMS Proteomic Pipeline)

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