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Package: ncbi-seg (0.0.20000620-5)

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strumento per mascherare segmenti con bassa complessità composizionale in sequenze di amminoacidi

ncbi-seg (alias SEG) è un programma per identificare e mascherare segmenti con bassa complessità composizionale in sequenze di amminoacidi.

ncbi-seg divide le sequenze in segmenti contrastanti con bassa complessità e alta complessità. I segmenti con bassa complessità definiti dall'algoritmo rappresentano "sequenze semplici" o "regioni con bias composizionale".

Questo programma è inappropriato per mascherare sequenze di nucleotidi e, infatti, può rimuovere alcuni codici di ambiguità da sequenze di nucleotidi mentre vengono lette.

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