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Package: libpll0 (0.3.2-2)

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libreria per verosimiglianza filogenetica

PLL รจ una libreria software altamente ottimizzata e parallelizzata per facilitare lo sviluppo di nuovi strumenti software relativi all'inferenza filogenetica.

Tra le funzioni incluse in PLL ci sono l'analisi di allineamenti di sequenze multiple (MSA) da file PHYLIP e FASTA, la lettura di alberi Newick, spostamenti topologici come SPR e NNI, l'ottimizzazione di modelli, la valutazione della verosimiglianza e l'analisi partizionata assegnando diversi modelli di sostituzione a ciascuna partizione dell'MSA. PLL implementa completamente il modello di sostituzione di nucleotidi GTR per dati di DNA e diversi modelli per dati di amminoacidi.

Questo pacchetto contiene la libreria dinamica.

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i386 169.1 kB458.0 kB [list of files]