Package: plip (1.4.3~b+dfsg-2)

[ Source: plip  ]

strumento di profilazione dell'interazione proteina-ligando completamente automatizzato

PLIP (Protein-Ligand Interaction Profiler) è uno strumento per analizzare e visualizzare interazioni proteina-ligando in file PDB.

Le sue funzionalità comprendono:

 * rilevamento di otto diversi tipi di interazioni non covalenti;
 * rilevamento automatico dei ligandi rilevanti in un file PDB;
 * scaricamento diretto di strutture PDB da server wwPDB se viene fornito
   un ID di PDB valido;
 * elaborazione di file PDB personalizzati contenenti complessi proteina-
   ligando (es. dal docking);
 * nessuna necessità per preparazione speciale di un file PDB, funziona
   così come è;
 * rapporti su interazioni a livello di atomi nei formati rST e XML per
   una facile analisi;
 * generazione di file di sessione di PyMOL (.pse) per ogni accoppiamento,
   che permette una facile preparazione di immagini per pubblicazioni e
   presentazioni;
 * rendering di immagini di anteprima per ciascun ligando e le sue
   interazioni con la proteina.

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