Package: infernal (1.1.2-2)

[ Source: infernal  ]

inferenza degli allineamenti strutturali secondari dell'RNA

Infernal ("INFERence of RNA ALignment", "inferenza per l'allineamento dell'RNA") cerca in un database di sequenze DNA somiglianze tra strutture e sequenze di RNA. Fornisce un'implementazione di un caso speciale delle grammatiche senza contesto con profilo stocastico chiamate modelli covarianti (CM). Un CM è come un profilo di sequenza, ma dà una valutazione combinando il consenso della sequenza e il consenso sulla struttura secondaria dell'RNA, così in molti casi è più efficace nell'identificare omologhi RNA che conservano la loro struttura secondaria più che la loro sequenza primaria.

Questo strumento è una parte integrante del database Rfam.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

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