Package: glam2 (1064-5)
Links for glam2
Debian Resources:
Download Source Package glam2:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
External Resources:
- Homepage [acb.qfab.org]
Similar packages:
motivi proteici con interruzioni da sequenze non allineate
GLAM2 è un pacchetto software per trovare motivi all'interno di sequenze, tipicamente sequenze amminoacidiche o nucleotidiche. Un motivo è un modello di sequenze che si ripete: esempi tipici sono i TATA box o il motivo di prenilazione CAAX. La maggiore innovazione portata da GLAM2 è che permette di avere inserzioni e delezioni all'interno dei motivi.
Questo pacchetto include programmi per scoprire motivi condivisi da un insieme di sequenze e trovare le corrispondenze a questi motivi in un database di sequenze, così come utilità per convertire motivi glam2 in formati standard per allineamenti, fare maschere di motivi glam2 in sequenze in modo da poter trovare motivi più deboli e rimuovere membri altamente simili da un insieme di sequenze.
Questo pacchetto include i seguenti programmi:
glam2: scopre motivi condivisi da un insieme di sequenze; glam2scan: trova corrispondenze, all'interno di un database di sequenze, con un motivo scoperto da glam2; glam2format: converte motivi glam2 in formati di allineamento standard; glam2mask: maschera motivi glam2 dalle sequenze, così che possano essere trovati motivi più deboli; glam2-purge: rimuove elementi altamente simili da un insieme di sequenze.
In questo pacchetto binario è stato abilitato l'algoritmo FFT (Fast Fourier Transform) per glam2.
Other Packages Related to glam2
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- dep: libc6 (>= 2.7)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)
- libreria per calcolare la trasformata di Fourier veloce (FFT) - precisione doppia
Download glam2
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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i386 | 233.8 kB | 519.0 kB | [list of files] |