Package: ctdconverter (2.0-4)

[ Source: ctdconverter  ]

converte file CTD in file per lo strumento Galaxy e per CWL CommandLineTool

Common Tool Descriptors (CTD) sono documenti XML che rappresentano input, output e parametri di strumenti a riga di comando in maniera indipendente dalla piattaforma.

CTDConverter, dati uno o più file XML Common Tool Descriptors (CTD), genera wrapper per strumenti Galaxy e descrizioni standard Common Workflow Language (CWL) Command Line Tool v1.0 da file CTD.

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  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: python3-ctdopts

  conferisce agli strumenti Python un'interfaccia compatibile con CTD

• dep: python3-lxml

  collegamento pythonico per le librerie libxml2 e libxslt

• dep: python3-pkg-resources

  rilevazione di pacchetti e accesso a risorse usando pkg_resources

• dep: python3-ruamel.yaml

  analizzatore/emettitore YAML di roundtrip (modulo per Python 3)

• sug: cwl-runner

  virtual package provided by cwltool, toil

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