[ Source: cnvkit ]
Package: cnvkit (0.9.5-3)
Links for cnvkit
Debian Resources:
Download Source Package cnvkit:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Olivier Sallou (QA Page)
External Resources:
- Homepage [cnvkit.readthedocs.org]
Similar packages:
rilevamento della variabilità del numero di copie da sequenziamento mirato di DNA
Un toolkit a riga di comando e una libreria Python per rilevare la variabilità del numero di copie e le alterazioni a livello di tutto il genoma da sequenziamento mirato di DNA. È progettato per l'uso con catture ibride, inclusi sia l'esoma intero, sia pannelli obiettivo personalizzati, e piattaforme di sequenziamento con letture corte come Illumina e Ion Torrent.
Other Packages Related to cnvkit
|
|
|
|
-
- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
-
- dep: python3-biopython
- libreria Python per bioinformatica (implementata in Python 3)
-
- dep: python3-future
- compatibilità pulita con Python 3 e 2 in un singolo sorgente - Python 3.x
-
- dep: python3-matplotlib
- sistema di tracciamento grafici basato su Python in uno stile simile a Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-numpy
- veloce struttura per array per il linguaggio Python 3
-
- dep: python3-pandas
- strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati" - Python 3
-
- dep: python3-pyfaidx
- accesso casuale efficiente per sottosequenze FASTA in Python 3
-
- dep: python3-pysam
- interfaccia al formato SAM/BAM per allineamento e mappatura di sequenze (Python 3)
-
- dep: python3-reportlab
- libreria ReportLab per creare documenti PDF usando Python3
-
- dep: python3-scipy
- strumenti scientifici per Python 3
-
- dep: r-bioc-dnacopy
- R package: DNA copy number data analysis
Download cnvkit
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 22,378.8 kB | 22,874.0 kB | [list of files] |