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sistema di grafica e modellamento molecolare

Avogadro è un sistema di grafica e modellamento molecolare pensato per molecole e biomolecole. Può visualizzare proprietà come orbitali molecolari o potenziali elettrostatici e ha uno strumento di uso intuitivo per la creazione di molecole.

Le sue caratteristiche includono:

 * modellatore molecolare con ottimizzazione automatica geometrica basata
   sui campi di forze;
 * meccanica molecolare comprese ricerche di limiti e conformazioni;
 * visualizzazione di orbitali molecolari e iso-superfici generiche;
 * visualizzazione di vibrazioni e disegno degli spettri vibrazionali;
 * gestione di unità a cella cristallografiche;
 * generazione di input per i pacchetti di chimica quantistica Gaussian,
   GAMESS e MOLPRO;
 * architettura flessibile a plugin e script Python.

Tra i formati di file che Avogadro può leggere sono inclusi PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, oltre all'output di Gaussian, GAMESS e MOLPRO.

Tags: Field: Chemistry, User Interface: Graphical User Interface, X Window System, Role: role::program, uitoolkit::qt, Purpose: Data Visualization, X Window System: Application

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