Package: r-cran-adegenet (2.1.1-2)

[ Source: r-cran-adegenet  ]

analisi esplorative di GNU R per dati genetici e genomici

Insieme di strumenti per l'esplorazione di dati genetici e genomici. Adegenet fornisce classi formali (S4) per memorizzare e gestire vari dati genetici, inclusi marcatori genetici con ploidia variabile e struttura di popolazione gerarchica (classe "genind"), conteggi di alleli per popolazioni ("genpop") e dati SNP a livello di tutto genoma ("genlight"). Implementa anche metodi multivariati originali (DAPC, sPCA), grafici, test statistici, strumenti di simulazione, misure di distanza e similarità e diversi metodi spaziali. Viene fornita anche una gamma di insiemi di dati, empirici e simulati, per illustrare i vari metodi.

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