[ Source: mafft ]
Package: mafft (7.407-2)
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- Homepage [mafft.cbrc.jp]
Similar packages:
programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche
MAFFT è un programma per l'allineamento di sequenze multiple che offre tre metodi orientati all'accuratezza:
* L-INS-i (probabilmente il più accurato; raccomandato per meno di 200 sequenze; metodo di raffinamento con iterazioni che incorpora informazioni sull'allineamento locale di coppie); * G-INS-i (adatto per sequenze di lunghezza simile; raccomandato per meno di 200 sequenze; metodo di raffinamento con iterazioni che incorpora informazioni sull'allineamento globale di coppie); * E-INS-i (adatto per sequenze contenenti grandi regioni non allineabili; raccomandato per meno di 200 sequenze);e cinque metodi orientati alla velocità:
* FFT-NS-i (metodo di raffinamento con iterazioni; solo due cicli); * FFT-NS-i (metodo di raffinamento con iterazioni; massimo 1000 iterazioni); * FFT-NS-2 (veloce; metodo progressivo); * FFT-NS-1 (molto veloce; raccomandato per più di 2000 sequenze; metodo progressivo con un albero guida grezzo); * NW-NS-PartTree-1 (raccomandato per ~50.000 sequenze; metodo progressivo con l'algoritmo PartTree).
Other Packages Related to mafft
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- Libreria C GNU: librerie condivise
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- interprete per il linguaggio di scripting orientato agli oggetti Ruby (versione predefinita)
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- enh: t-coffee
- allineamento di sequenze multiple
Download mafft
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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arm64 | 852.7 kB | 9,972.0 kB | [list of files] |