Package: r-bioc-bsgenome (1.50.0-1)

[ Source: r-bioc-bsgenome  ]

infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

Questo modulo BioConductor fornisce una qualche infrastruttura di base per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings.

Other Packages Related to r-bioc-bsgenome

• dep: r-api-3.5

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.5.1-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.8)

  funzioni generiche per Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.10)

  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.16)

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-rsamtools

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)

  interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.28)

  implementazione di vettori e liste per BioConductor S4

• dep: r-bioc-xvector

  rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor

• rec: r-bioc-biovizbase (>= 1.14.0)

  utilità grafiche di base per GNU R per la visualizzazione di dati genomici

• sug: r-bioc-biobase

  funzioni base per Bioconductor

• sug: r-cran-biocmanager

  accesso al repository dei pacchetti del progetto Bioconductor

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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