Package: poretools (0.6.0+dfsg-3)

[ Source: poretools  ]

toolkit per dati Nanopore di sequenziamento di nucleotidi

poretools è un toolkit flessibile per esplorare insiemi di dati generati da dispositivi Nanopore di sequenziamento da MinION con gli scopi di controllo di qualità e di analisi a valle. poretools opera direttamente sul formato di file nativo FAST5 (una variante dello standard HDF5) prodotto da ONT e fornisce una vasta gamma di utilità per convertire formati e strumenti per visualizzazione ed esplorazione dei dati.

Other Packages Related to poretools

• dep: python

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)

• dep: python-h5py

  interfaccia Python di uso generico per hdf5 (Python 2)

• dep: python-matplotlib

  sistema di tracciamento grafici basato su Python in uno stile simile a Matlab

• dep: python-pandas

  strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"

• dep: python-pkg-resources

  rilevazione di pacchetti e accesso a risorse usando pkg_resources

• dep: python-seaborn

  libreria di visualizzazione statistica per Python

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