Package: maqview (0.2.5-9)

[ Source: maqview  ]

visualizzatore grafico di allineamento di letture per brevi sequenze geniche

Maqview è un visualizzatore grafico di allineamenti di letture. È specificamente progettato per i file di allineamento Maq e permette di vedere non corrispondenze, qualità delle basi e qualità della mappatura. Maqview non è sofisticato come Consed o GAP, ma è solamente un semplice visualizzatore per vedere ciò che succede in una particolare regione.

In confronto a tgap-maq, il visualizzatore testuale di allineamenti di letture scritto da James Bonfield, Maqview è più veloce e usa molta meno memoria e spazio su disco durante l'indicizzazione. Ciò è possibile perché tgap mira ad essere un visualizzatore universale, mentre Maqview sfrutta a pieno il fatto che un file di allineamento Maq è già stato ordinato. Maqview è efficiente anche nella visualizzazione e fornisce uno strumento a riga di comando per recuperare velocemente qualsiasi regione in un file di allineamento Maq.

Other Packages Related to maqview

• dep: freeglut3

  OpenGL Utility Toolkit

• dep: libc6 (>= 2.15)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

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• dep: libgl1

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  libreria Mesa OpenGL Utility (GLU)

  or libglu1

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• dep: libstdc++6 (>= 5)

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	110.8 kB	630.0 kB	[list of files]