Package: kissplice (2.4.0-p1-4)

[ Source: kissplice  ]

rilevamento di vari tipi di polimorfismi in dati RNA-Seq

KisSplice è un software che permette l'analisi di dati RNA-Seq con o senza un genoma di riferimento. È un assemblatore esatto di trascrittoma che permette di identificare SNP, indel e eventi di splicing alternativo. Può lavorare con un numero arbitrario di condizioni biologiche e quantifica ciascuna variante in ogni condizione. È stato provato su insiemi di dati Illumina con fino a 1G di letture. Il suo consumo di memoria è di circa 5Gb per 100M letture.

Other Packages Related to kissplice

• dep: libc6 (>= 2.27)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: python

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	770.0 kB	1,398.0 kB	[list of files]