Package: freebayes (1.2.0-2)

[ Source: freebayes  ]

scoperta e genotipizzazione bayesiana di polimorfismo basati su aplotipi

FreeBayes è un rilevatore bayesiano di varianti genetiche progettato per trovare piccoli polimorfismi, specificamente SNP (single-nucleotide polymorphism), indel (inserzioni e delezioni), MNP (multi-nucleotide polymorphism) ed eventi complessi (eventi di sostituzione e inserzione compositi) più piccoli della lunghezza di un allineamento di sequenziamento di letture corte.

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  libreria dinamica per manipolare file BAM (allineamento di genoma)

• dep: libc6 (>= 2.14)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  libreria per la misura dell'entropia di flussi di byte

• dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f)

  libreria per indicizzare ed estrarre sequenze da file FASTA (libreria)

• dep: libfml0

  libreria per assemblare letture corte Illumina in regioni piccole

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libhts2 (>= 1.0)

  libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni

• dep: libjsoncpp1 (>= 1.7.4)

  libreria per leggere e scrivere JSON per C++

• dep: libseqlib1 (>= 1.1.2+dfsg)

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

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• dep: libssw0

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: libtabixpp0

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib1

  libreria C++ per analizzare e manipolare file VCF

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• rec: parallel

  crea ed esegue righe di comando dallo standard input in parallelo

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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