[ Source: bowtie2 ]
Package: bowtie2-examples (2.3.4.3-1)
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Debian Resources:
Download Source Package bowtie2:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Alexandre Mestiashvili (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
External Resources:
- Homepage [bowtie-bio.sourceforge.net]
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esempi per bowtie2
Uno strumento ultraveloce che usa la memoria in maniera efficiente per allineare letture di sequenziamento a sequenze lunghe di riferimento. È particolarmente adatto per allineare letture da circa 50 fino a centinaia o migliaia di caratteri e particolarmente adatto per allineare a genomi relativamente lunghi (es. mammiferi).
Bowtie 2 indicizza il genoma con un indice FM per mantenere bassa l'impronta di memoria: per il genoma umano, la sua impronta di memoria è tipicamente intorno a 3,2 GB. Bowtie 2 gestisce le modalità di allineamento con gap, locali e a estremità accoppiate.
Questo pacchetto fornisce alcuni dati d'esempio per lavorare con bowtie2.
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Download bowtie2-examples
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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