Package: cain (1.10+dfsg-3)

[ Source: cain  ]

simulazioni di reazioni chimiche

Cain effettua simulazioni stocastiche e deterministiche di reazioni chimiche. Può generare più processi di simulazione per utilizzare computer con più core. Memorizza l'output di modelli, metodi e simulazioni (conteggi di popolazioni e di reazioni) in un formato XML. In aggiunta i modelli SBML possono essere importati ed esportati. I modelli e i metodi possono essere letti da file di input o modificati all'interno del programma.

La GUI (Graphical User Interface, interfaccia utente grafica) è scritta in Python e utilizza il toolkit wxPython. La maggior parte dei risolutori sono implementati come eseguibili da riga di comando, scritti in C++, che sono pilotati da Cain. Questo rende semplice eseguire lavori non interattivi. Semplifica anche il processo di aggiunta di nuovi risolutori. Cain mette a disposizione diversi risolutori:

 * metodo diretto di Gillespie,
 * metodo della prima reazione di Gillespie,
 * metodo della prossima reazione di Gibson e Bruck,
 * tau-leaping,
 * ibrido diretto/tau-leaping,
 * integrazione ODE.

Questo pacchetto fornisce i file indipendenti dall'architettura per cain.

Other Packages Related to cain

• dep: cain-solvers

  risolutori per cain

• dep: python

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)

  dep: python (<< 3.0)

• dep: python-matplotlib

  sistema di tracciamento grafici basato su Python in uno stile simile a Matlab

• dep: python-numpy

  aggiunge una veloce struttura per array al linguaggio Python

• dep: python-scipy

  strumenti scientifici per Python

• dep: python-sympy

  CAS (Computer Algebra System) in Python

• dep: python-wxgtk3.0

  interfaccia Python al toolkit wxWidgets per GUI C++ multipiattaforma

• rec: cain-examples

  esempi per cain

Download cain

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	10,501.3 kB	15,975.0 kB	[list of files]