Package: velvet-long (1.2.10+dfsg1-7)

[ Source: velvet  ]

assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte, versione lunga

Velvet è un assemblatore genomico de novo progettato specificatamente per le tecnologie di sequenziamento basate su sequenze corte, come Solexa o 454, sviluppato da Daniel Zerbino e Ewan Birney all'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), vicino a Cambridge, in Gran Bretagna.

Velvet attualmente accetta sequenze molto corte, rimuove errori e poi produce frammenti contigui unici di alta qualità. Poi usa informazioni sulle paired-read, se disponibili, per recuperare le aree ripetute tra i vari frammenti contigui.

Questo pacchetto installa versioni speciali in modalità lunga di Velvet, come raccomandato nei tutorial di Velvet.

Other Packages Related to velvet-long

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: velvet

  assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  libreria di compressione - runtime

Download velvet-long

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	204.0 kB	1,839.0 kB	[list of files]
arm64	197.3 kB	1,734.0 kB	[list of files]
armel	220.6 kB	2,101.0 kB	[list of files]
armhf	203.6 kB	1,306.0 kB	[list of files]
i386	240.7 kB	2,305.0 kB	[list of files]
mips64el	203.3 kB	2,296.0 kB	[list of files]
mipsel	230.3 kB	2,424.0 kB	[list of files]
ppc64el	219.8 kB	2,639.0 kB	[list of files]
s390x	197.9 kB	1,970.0 kB	[list of files]