Package: resfinder (3.2-3)

[ Source: resfinder  ]

identifica geni acquisiti di resistenza agli antimicrobici

ResFinder identifica geni acquisiti di resistenza agli antimicrobici in isolati batterici totalmente o parzialmente sequenziati.

ResFinder usa BLAST per l'identificazione di geni acquisiti di resistenza agli antimicrobici in dati di genomi interi. Come input il metodo può usare sia genomi completi o parziali pre-assemblati sia letture corte di sequenze da quattro diverse piattaforme di sequenziamento. Il metodo è stato valutato su 1862 file GenBank contenenti 1411 differenti geni di resistenza, oltre a 23 isolati sequenziati de-novo.

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