Package: pyvcf (0.6.8+git20170215.476169c-7)

[ Source: python-pyvcf  ]

script ausiliari per l'analizzatore di Variant Call Format (VCF)

Variant Call Format (VCF) specifica il formato di un file di testo usato in bioinformatica per memorizzare variazioni di sequenze di geni. Il formato è stato sviluppato con l'avvento di progetti di sequenziamento di DNA e di genotipizzazione su larga scala, come il 1000 Genomes Project.

L'intento di questo modulo è di imitare il modulo "csv" nella stdlib di Python, in contrasto con formati più flessibili di serializzazione come JSON o YAML. "vcf" tenterà di analizzare il contenuto di ogni record sulla base dei tipi di dato specificati nelle righe di meta-informazioni, e precisamente le righe ##INFO e ##FORMAT. Se tali righe sono mancanti o incomplete, controllerà i tipi riservati menzionati nelle specifiche. In mancanza di ciò, restituirà semplicemente delle stringhe.

Questo pacchetto fornisce degli script ausiliari che usano python3-pyvcf.

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