Package: exonerate (2.4.0-5)
Links for exonerate
Debian Resources:
Download Source Package exonerate:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.ebi.ac.uk]
Similar packages:
strumento generico per il confronto di sequenze di coppie
Exonerate permette l'allineamento di sequenze tramite molti modelli di allineamento, usando una programmazione dinamica esaustiva o una varietà di euristiche. Molte delle funzionalità della suite di programmazione dinamica Wise sono state reimplementate in C per una migliore efficienza. Exonerate è un componente intrinseco della struttura dei database genomici Ensembl, che fornisce punteggi di somiglianza tra sequenze di RNA e di DNA e così determinando varianti di splicing e sequenze di codifica generali.
Un sistema di simulazione per esperimenti PCR In-silico (vedere la pagina man di ipcress) è fornito con exonerate.
Questo pacchetto contiene una selezione di utilità per effettuare velocemente semplici manipolazioni su file fasta oltre i 2 Gb.
Other Packages Related to exonerate
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libglib2.0-0 (>= 2.24.0)
- libreria GLib di routine in C
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- sug: wise
- confronto tra biopolimeri, come DNA e sequenze proteiche
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- enh: bioperl-run
- wrapper BioPerl: script
Download exonerate
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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s390x | 1,446.3 kB | 9,768.0 kB | [list of files] |