Package: igv (2.6.3+dfsg-3) [non-free]

[ Source: igv  ]

Integrative Genomics Viewer

Integrative Genomics Viewer (IGV) è un visualizzatore ad alte prestazioni che gestisce in modo efficiente vasti insiemi di dati eterogenei, fornendo al contempo un'esperienza utente lineare e intuitiva a tutti i livelli di risoluzione del genoma. Una caratteristica chiave di IGV è la sua attenzione alla natura integrata degli studi genomici, con gestione dei dati sia basati su array sia su sequenziamento di prossima generazione, e l'integrazione di dati clinici e fenotipici. Sebbene IGV sia spesso utilizzato per visualizzare dati genomici da fonti pubbliche, è principalmente focalizzato a supportare i ricercatori che desiderano visualizzare i propri insiemi di dati o quelli di colleghi. A tale scopo IGV supporta il caricamento flessibile di insiemi di dati locali e remoti ed è ottimizzato per fornire visualizzazione ed esplorazione ad alte prestazioni su sistemi desktop standard.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::java, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, network::client, Network Protocol: HTTP, Role: Program, Scope: scope::utility, use::viewing, Works with: Biological Sequence, X Window System: Application

Other Packages Related to igv

• dep: default-jre

  runtime Java standard o compatibile

• dep: libbatik-java

  libreria SVG di xml.apache.org

• dep: libcommons-io-java

  utili classi comuni relative all'IO

• dep: libcommons-logging-java

  interfaccia wrapper comune per diverse API di log

• dep: libcommons-math-java

  componenti Java leggeri per matematica e statistica

• dep: libgoogle-gson-java

  Converts Java objects into their JSON representation

• dep: libguava-java

  suite di librerie comuni di Google per Java

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• dep: libjaxb-api-java

  Java Architecture for XML Binding API

• dep: libjcommon-java

  libreria di uso generico per Java

• dep: libjfreechart-java

  libreria per grafici in Java

• dep: libjgrapht0.8-java

  mathematical graph theory library for Java

• dep: libjide-oss-java

  extensible Swing component library for Java

• dep: liblog4j1.2-java

  libreria di log per java

• dep: liblog4j2-java

  Apache Log4j - Logging Framework for Java

• dep: libnb-absolutelayout-java

  Java LayoutManager to allow placement in absolute positions

• dep: libswing-layout-java

  estensioni per Swing layout

• dep: libxml-commons-external-java

  codice esterno per XML Commons - DOM, SAX, JAXP, ecc.

• rec: libmariadb-java

  driver per database Java per MariaDB e MySQL

Download igv

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	3,305.1 kB	3,649.0 kB	[list of files]