Package: ragout-examples (2.3-2)

[ Source: ragout  ]

Reference-Assisted Genome Ordering UTility (dati d'esempio)

Ragout (Reference-Assisted Genome Ordering UTility) è uno strumento per creare scaffold a livello di cromosoma che usa riferimenti multipli. Dati dei frammenti iniziali di assemblamento (contig/scaffold) e uno o più riferimenti correlati (completi o bozze), produce un assemblato su scala di cromosoma (come insieme di scaffold).

L'approccio è basato sull'analisi di riarrangiamenti genomici (come inversioni o traslocazioni cromosomiche) tra i genomi di input e sulla ricostruzione della struttura più parsimoniosa del genoma obiettivo.

Ragout ora gestisce genomi sia piccoli sia grandi (di scala e complessità dei Mammiferi). L'assemblaggio di genomi altamente polimorfici è attualmente limitato.

Questo pacchetto contiene dati d'esempio per testare ragout.

Download ragout-examples

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	18,002.1 kB	18,023.0 kB	[list of files]