Package: covtobed (1.2.0+dfsg-1)

[ Source: covtobed  ]

converte la traccia di copertura da un file BAM in un file BED

Legge uno o più file di allineamento (BAM ordinati) e stampa un BED con la copertura. Unirà basi consecutive con la stessa copertura e può essere usato per stampare un file BED solamente con le regioni che hanno uno specifico intervallo di copertura.

Other Packages Related to covtobed

• dep: bamtools

  toolkit per manipolare file BAM (allineamento di genoma)

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  libreria dinamica per manipolare file BAM (allineamento di genoma)

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	43.4 kB	155.0 kB	[list of files]