Package: anfo (0.98-8)

[ Source: anfo  ]

strumento per allineare/mappare letture corte da MPG

Anfo è uno strumento per mappatura nello spirito di Soap/Maq/Bowtie, ma la sua implementazione assomiglia più a BLAST/BLAT. È utile soprattutto per l'allineamento di letture di sequenze in cui la sequenza di DNA è in qualche modo modificata (si pensi a DNA ancestrale o a trattamento con bisolfito) o c'è più divergenza tra il campione e il riferimento di quanta viene gestita bene dai mappatori veloci (ad esempio il genoma di riferimento è mancante e viene usata invece una specie correlata).

Other Packages Related to anfo

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  libreria per strumento per allineare/mappare letture corte da MPG

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libelk0

  implementazione di Scheme (Extension Language Kit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  libreria per l'analisi dei parametri della riga di comando

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.3)

  libreria C++ per Protocol Buffers

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	109.5 kB	438.0 kB	[list of files]