Package: garlic-doc (1.6-1.1)

[ Source: garlic-doc  ]

[Chimica] programma per la visualizzazione di molecole - documentazione

Questo è il pacchetto di documentazione per Garlic.

Garlic è probabilmente il programma di visualizzazione molecolare più portabile nel mondo UNIX. È stato scritto per lo studio di proteine di membrana. Può essere usato per visualizzare altre proteine ed anche altri oggetti geometrici. Il nome ("garlic" significa aglio in inglese) richiama la struttura ed il funzionamento di questo programma. Questa versione di garlic riconosce il formato PDB versione 2.1. Garlic può anche essere usato per analizzare sequenze proteiche.

Le sue caratteristiche includono (ma non sono limitate a):

  - la posizione e lo spessore del piano di sezione sono visibili in una
    piccola finestra;
  - i legami atomici, così come gli atomi, sono trattati come oggetti
    disegnabili indipendentemente;
  - i colori degli atomi e dei legami dipendono dalla posizione: sono
    disponibili cinque modalità di mappatura (come per i piani);
  - possibilità di visualizzare immagini stereo;
  - possibilità di visualizzare altri oggetti geometrici, come la membrana;
  - le informazioni sugli atomi sono disponibili per l'atomo su cui è
    posizionato il puntatore del mouse: non è necessario fare clic,
    semplicemente muovere il mouse sopra la struttura!;
  - capacità di caricare più di una struttura;
  - capacità di disegnare grafici di Ramachandran, strutture delle
    alfa-eliche, diagrammi di Venn, grafici di idrofobicità media e di
    momento idrofobico;
  - il prompt dei comandi è disponibile alla base della finestra principale
    e può visualizzare un messaggio di errore e una stringa di comando.

Tags: Field: Biology, Chemistry, Role: Documentation, role::program, use::viewing

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