Package: gromacs-openmpi (2020.6-2)

[ Source: gromacs  ]

simulatore di dinamica molecolare, binari per parallelizzazione OpenMPI

GROMACS è un pacchetto versatile per l'esecuzione di dinamiche molecolari, ovvero simulazioni delle equazioni newtoniane del moto per sistemi con un numero di particelle tra le centinaia e i milioni.

Progettato principalmente per biomolecole come proteine e lipidi con molte complesse interazioni di legame, GROMACS, essendo estremamente veloce nei calcoli per le interazioni di non-legame (che solitamente dominano le simulazioni) è anche utilizzato da molti gruppi per ricerche su sistemi non biologici, come ad esempio polimeri.

Questo pacchetto contiene solamente il motore principale di simulazione con gestione parallela usando l'interfaccia OpenMPI. È adatto per i nodi di un cluster di elaborazione o per macchine multiprocessore.

Tags: Software Development: C Development, Libraries, Field: Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::devel-lib, role::program, Scope: Utility, Works with: Packaged Software

Other Packages Related to gromacs-openmpi

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

  libreria per calcolare la trasformata di Fourier veloce (FFT) - precisione doppia

• dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

  libreria per calcolare la trasformata di Fourier veloce (FFT) - precisione singola

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libhwloc15 (>= 2.4.1+dfsg)

  vista gerarchica della macchina - librerie condivise

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.0)

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa

• dep: libstdc++6 (>= 10.2) [armel]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [amd64, i386, ppc64el]

  dep: libstdc++6 (>= 6) [not amd64, armel, i386, ppc64el]

• dep: neon-support [armhf]

  previene l'installazione su processori senza le istruzioni richieste

• dep: openmpi-bin (>= 1.2.3)

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni -- binari

• dep: sse2-support [i386]

  previene l'installazione su processori senza le istruzioni richieste

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  libreria di compressione - runtime

• rec: gromacs

  simulatore di dinamica molecolare, con strumenti di costruzione e di analisi

• sug: gromacs-data

  GROMACS simulatore di dinamica molecolare, dati e documentazione

Download gromacs-openmpi

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	6,706.4 kB	18,087.0 kB	[list of files]
arm64	5,312.4 kB	14,429.0 kB	[list of files]
armel	3,418.7 kB	11,927.0 kB	[list of files]
armhf	3,221.0 kB	8,735.0 kB	[list of files]
i386	5,969.2 kB	18,371.0 kB	[list of files]
mips64el	3,764.4 kB	14,581.0 kB	[list of files]
mipsel	3,905.4 kB	14,117.0 kB	[list of files]
ppc64el	4,391.1 kB	14,645.0 kB	[list of files]
s390x	3,280.8 kB	13,059.0 kB	[list of files]