Package: bppsuite (2.4.1-3)

[ Source: bppsuite  ]

suite di programmi Bio++

La suite di programmi Bio++ è un pacchetto di programmi che usano le librerie Bio++ e che sono dedicati alla filogenetica e all'evoluzione molecolare. Tutti i programmi sono indipendenti, ma possono essere combinati per eseguire analisi piuttosto complesse. Questi programmi usano gli strumenti ausiliari di interfaccia delle librerie e perciò condividono la stessa sintassi. Hanno anche svariate opzioni in comune che possono essere condivise da software di terze parti.

Include i programmi:

 - BppML per analisi di massima verosimiglianza,
 - BppSeqGen per simulazione di sequenze,
 - BppAncestor per ricostruzione di stati ancestrali,
 - BppDist per metodi di distanza,
 - BppPars per analisi di parsimonia,
 - BppSeqMan per conversioni di file e manipolazione di sequenze,
 - BppConsense per costruire alberi di consenso e calcolare valori di
   bootstrap,
 - BppReRoot per cambiamento degli elementi radice dell'albero,
 - BppTreeDraw per disegnare alberi,
 - BppAlnScore per confrontare allineamenti e calcolare punteggi di
   allineamento,
 - BppMixedLikelihoods per calcolare verosimiglianze sito per sito
   di componenti di modelli mistura,
 - BppPopGen per analisi di genetica di popolazione.

Other Packages Related to bppsuite

• dep: libbpp-core4 (>= 2.4.1)

  libreria principale di Bio++

• dep: libbpp-phyl12 (>= 2.4.1)

  libreria filogenetica di Bio++

• dep: libbpp-popgen8 (>= 2.4.1)

  libreria per genetica di popolazione di Bio++

• dep: libbpp-seq12 (>= 2.4.1)

  libreria per sequenze di Bio++

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 10.2.0-7) [armel]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel]

• sug: bppsuite-examples

  esempi per la suite di programmi Bio++

Download bppsuite

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	375.9 kB	1,994.0 kB	[list of files]
arm64	345.7 kB	1,922.0 kB	[list of files]
armel	312.1 kB	1,550.0 kB	[list of files]
armhf	321.7 kB	1,278.0 kB	[list of files]
i386	378.9 kB	1,862.0 kB	[list of files]
mips64el	340.8 kB	2,226.0 kB	[list of files]
mipsel	340.7 kB	2,026.0 kB	[list of files]
ppc64el	371.8 kB	2,614.0 kB	[list of files]
s390x	338.6 kB	2,018.0 kB	[list of files]