[ Source: r-bioc-genomicalignments ]
Package: r-bioc-genomicalignments (1.26.0-1)
Links for r-bioc-genomicalignments
Debian Resources:
Download Source Package r-bioc-genomicalignments:
- [r-bioc-genomicalignments_1.26.0-1.dsc]
- [r-bioc-genomicalignments_1.26.0.orig.tar.gz]
- [r-bioc-genomicalignments_1.26.0-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioconductor.org]
Similar packages:
rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor
Questo pacchetto BioConductor fornisce contenitori efficienti per memorizzare e manipolare allineamenti genomici corti (ottenuti tipicamente allineando letture corte ad un genoma di riferimento). Ciò include contare le letture, calcolare la copertura, rilevare le giunzioni e lavorare con il contenuto in nucleotidi degli allineamenti.
Other Packages Related to r-bioc-genomicalignments
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.12
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)
- nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R
-
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3)
- funzioni generiche per Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocparallel
- funzionalità BioConductor per valutazione parallela
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.55.7)
- oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.13.1)
- utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi
-
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5)
- rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)
- contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R
-
- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)
- allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- implementazione di vettori e liste per BioConductor S4
-
- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.9.13)
- BioConductor assay container
-
- rec: r-bioc-shortread (>= 1.24.0)
- classi e metodi GNU R per grosse moli di dati di sequenziamento short-read
-
- rec: r-cran-runit
- pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-bsgenome
- infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings
-
- sug: r-bioc-deseq2
- pacchetto R per analisi RNA-Seq di espressione differenziale
-
- sug: r-bioc-edger
- analisi empiriche per dati digitali di espressione genica in R
-
- sug: r-bioc-genomicfeatures
- strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle
-
- sug: r-bioc-rtracklayer
- interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione
Download r-bioc-genomicalignments
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
armel | 2,140.5 kB | 2,966.0 kB | [list of files] |