Package: mhap (2.1.3+dfsg-3)

[ Source: mhap  ]

hash con sensibilità locale per rilevare sovrapposizioni di letture lunghe

MinHash Alignment Process (MHAP, pronunciato MAP) è un'implementazione di riferimento di un algoritmo probabilistico per la sovrapposizione di sequenze. È progettato per rilevare in maniera efficiente tutte le sovrapposizioni tra letture lunghe in dati di sequenze con rumore. Stima in maniera efficiente la similarità di Jaccard comprimendo le sequenze nelle loro impronte digitali rappresentative composte su min-meri (minimi k-meri).

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  algoritmo Smith-Waterman con miglioramento di Gotoh

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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